FlytBase permet l'importation de fichiers de mission aux formats suivants :
- Fichiers KML : couramment utilisés pour la représentation de données géographiques, permettant l’importation de trajectoires de vol complexes et de géorepérages.
- Fichiers WPML : fichiers de langage de mission de points de passage qui définissent des missions de points de passage spécifiques pour les drones.
- Fichiers KMZ : contiennent des données géospatiales compressées, notamment des trajectoires de vol, des géorepérages, des points d’intérêt et des superpositions pour la visualisation et le partage des missions.